Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MVDP53602 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MVDP53602 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MVDP53602 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms