Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EFNA3P52797 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms