Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRPC1P48995 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms