Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATRXP46100 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATRXP46100 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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