Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
APOBEC1P41238 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms