Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PTGER4P35408 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTGER4P35408 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms