Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ABCC1P33527 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ABCC1P33527 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms