Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms