Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HOXD10P28358 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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