Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DNMT1P26358 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms