Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTX3P26022 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PTX3P26022 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms