Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA6P23229 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA6P23229 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms