Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRHP20396 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRHP20396 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRHP20396 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRHP20396 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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