Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CD53P19397 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD53P19397 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD53P19397 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms