Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYN1P17600 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYN1P17600 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYN1P17600 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYN1P17600 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYN1P17600 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SYN1P17600 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYN1P17600 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYN1P17600 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYN1P17600 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms