Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREB1P16220 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB1P16220 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB1P16220 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB1P16220 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB1P16220 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREB1P16220 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CREB1P16220 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms