Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACADSP16219 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms