Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C4BP0C0L5 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C4BP0C0L5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms