Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CDK1P06493 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDK1P06493 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK1P06493 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK1P06493 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK1P06493 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK1P06493 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK1P06493 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDK1P06493 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDK1P06493 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDK1P06493 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms