Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDN1P05305 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDN1P05305 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDN1P05305 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDN1P05305 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDN1P05305 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EDN1P05305 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EDN1P05305 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDN1P05305 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDN1P05305 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDN1P05305 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDN1P05305 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDN1P05305 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDN1P05305 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDN1P05305 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EDN1P05305 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms