Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FRS3O43559 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FRS3O43559 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms