Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PLXNB1O43157 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.8 ms