Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
BHLHE40O14503 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BHLHE40O14503 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BHLHE40O14503 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms