Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC4-APOC2K7ER74 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms