Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NEDD8-MDP1E9PL57 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms