Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E9PBE3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E9PBE3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
E9PBE3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
E9PBE3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
E9PBE3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E9PBE3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E9PBE3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms