Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
B4DXG7 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
B4DXG7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
B4DXG7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms