Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
B4DGG1 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
B4DGG1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
B4DGG1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms