Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
SMIM1B2RUZ4 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms