Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3CA6NKF2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3CA6NKF2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms