Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NPIPB13A6NJU9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms