Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VWA8A3KMH1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VWA8A3KMH1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms