Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BIVM-ERCC5R4GMW8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms