Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAB39Q9Y376 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms