Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNRC6BQ9UPQ9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms