Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MRTO4Q9UKD2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MRTO4Q9UKD2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms