Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RIMS3Q9UJD0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms