Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC24A2Q9UI40 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC24A2Q9UI40 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC24A2Q9UI40 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC24A2Q9UI40 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC24A2Q9UI40 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC24A2Q9UI40 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC24A2Q9UI40 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms