Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms