Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC180Q9P1Z9 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC180Q9P1Z9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms