Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HCN3Q9P1Z3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms