Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GDE1Q9NZC3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GDE1Q9NZC3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms