Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG3Q9NT62 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG3Q9NT62 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms