Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRDM8Q9NQV8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM8Q9NQV8 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRDM8Q9NQV8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms