Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SRA1Q9HD15 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SRA1Q9HD15 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms