Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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C20orf27Q9GZN8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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C20orf27Q9GZN8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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C20orf27Q9GZN8 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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C20orf27Q9GZN8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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C20orf27Q9GZN8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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C20orf27Q9GZN8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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C20orf27Q9GZN8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C20orf27Q9GZN8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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