Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CEP44Q9C0F1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms