Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SMIM3Q9BZL3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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