Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC4A5Q9BY07 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms