Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF17Q9BXT8 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF17Q9BXT8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms